Seqüência de DNA da bactéria usada para mapear um surto de infecção:
Pela primeira vez, os pesquisadores usaram seqüenciamento de DNA para ajudar a trazer um surto de doença infecciosa em um hospital ao fim.
Pesquisadores do Instituto Wellcome Trust Sanger, da Universidade de Cambridge e Hospitais da Universidade de Cambridge usaram o DNA avançado tecnologias de seqüenciamento para confirmar a presença de um surto em andamento resistente à meticilinaStaphylococcus aureus(MRSA) em uma Unidade de Cuidados Especiais do bebê em tempo real. Isso ajudou a parar o surto anterior, economizando possíveis danos aos pacientes. Esta abordagem é muito mais preciso do que os métodos atuais usados para detectar surtos hospitalares.
Usando esta tecnologia, a equipe revelou que o surto se estendeu para a comunidade em geral, uma conclusão de que não poderia ser alcançado com os métodos disponíveis. Eles também usaram seqüenciamento de vincular o surto a uma transportadora desavisados, que foi tratado de erradicar a MRSA.
"Estamos sempre buscando formas de melhorar o nosso atendimento ao paciente e queria explorar o papel que as mais recentes tecnologias de seqüenciamento poderia jogar no controle de infecções em hospitais," diz o Dr. Nick Brown, autor, microbiologista consultor da Agência de Protecção da Saúde e controle de infecção médico no Hospital Addenbrooke, Cambridge. "Nosso objetivo é a prevenção de surtos, e no caso em que elas ocorrem para identificar estes rapidamente e com precisão e trazê-los sob controle.
"O que temos vislumbrado através deste estudo pioneiro é um futuro em que os métodos de sequenciamento novos nos ajudará a identificar, gerenciar e parar de surtos hospitalares e prestar cuidados de paciente ainda melhor."
Ao longo de um período de seis meses, o hospital equipe de controle de infecção usados protocolos padrão para identificar 12 pacientes que foram portadores do MRSA.No entanto, esta abordagem padrão por si só não poderia dar informações suficientes para confirmar ou refutar ou não um surto em curso foi realmente acontecendo.
Neste estudo, os pesquisadores analisaram isolados de MRSA a partir desses 12 pacientes com a tecnologia de seqüenciamento de DNA e demonstrou claramente que todas as bactérias MRSA estavam intimamente relacionadas e que este era um surto.Eles também revelaram que o surto foi mais extensa do que se pensava anteriormente, encontrando que mais de o dobro de pessoas estavam carregando ou foram infectados com a cepa surto. Muitos destes casos adicionais eram pessoas que tinham ligações recentes para o hospital, mas eram saudáveis e vivendo na comunidade, quando eles desenvolveram uma infecção por MRSA.
Embora este estudo sequenciamento estava em andamento, a equipe de controle de infecção identificado um novo caso de transporte MRSA na Unidade de Cuidados Especiais do bebê, que ocorreu 64 dias após o paciente MRSA positivo última havia deixado a mesma unidade. A equipe usou o DNA avançado de sequenciamento de mostrar em tempo real que esta cepa foi também parte do surto, apesar da falta de ligações aparentes entre este caso e os pacientes anteriores. Isto levantou a possibilidade de que um indivíduo foi inadvertidamente transporte e difusão do surto estirpe MRSA.
A equipe de controle de infecção selecionados 154 profissionais de saúde para MRSA e descobriu que um membro da equipe estava carregando MRSA. Usando seqüenciamento de DNA, que confirmou que esta cepa MRSA estava ligada ao surto.Este profissional de saúde foi rapidamente tratado para erradicar a carruagem MRSA e, assim, eliminar o risco de propagação.
"Nosso estudo destaca o poder de seqüenciamento de DNA avançado usado em tempo real de influenciar diretamente os procedimentos de controle de infecção", diz o Dr. Julian Parkhill, autor do Wellcome Trust Sanger Institute. "Há uma saúde real e carga de custos de surtos hospitalares e benefícios significativos para ser adquirida com a sua prevenção e contenção rápida. Esta tecnologia é uma grande promessa para a identificação rápida e precisa de transmissões de bactérias em nossos hospitais e poderia levar a uma mudança de paradigma na como gerenciar o controle de infecção e prática. "
Neste caso, seqüenciamento de DNA foi um passo fundamental em trazer o surto ao fim, salvar possíveis danos aos pacientes e poupando o dinheiro hospital.
"Nosso estudo indica o potencial considerável de seqüenciamento para a rápida identificação de surtos de MRSA", diz o professor Sharon Peacock, autora principal da Universidade de Cambridge e especialista em clínica na Agência de Proteção de Saúde."O que precisamos antes que isto possa ser introduzido na rotina de atendimento é de ferramentas automatizadas que interpretam dados de seqüência e fornecer informações compreensíveis para os trabalhadores da saúde. Estamos atualmente trabalhando em um tal sistema.
"Se nós temos um sistema robusto deste tipo em operação quando os surtos ocorrem, nós prevemos que será capaz de detê-los após os primeiros casos, como iremos encontrar rapidamente conexões claras".
Em sua próxima etapa, a equipe vai estudar todos os portadores de MRSA e de pacientes infectados durante o próximo ano no Hospital Addenbrooke, e os hospitais da vizinhança e da comunidade para entender os acontecimentos de transmissão com o objetivo de melhorar a gestão da infecção.
Sir Mark Walport, diretor do Wellcome Trust, diz:. "Esta é uma demonstração dramática que a genômica médicos não é mais uma tecnologia do futuro - é uma tecnologia do aqui e agora Ao colaborar com os médicos do SNS, os geneticistas têm demonstrado que sequenciamento pode ter aplicações extremamente importantes na área da saúde, hoje, deter um surto de uma doença potencialmente mortal. "
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